詹姆斯·M·弗格森
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2022
Gamaarachchi, H., H. Samarakoon, SP Jenner,JM弗格森, TG Amos, JM Hammond, H. Saadat, MA Smith, S. Parameswaran 和 IW Deveson (2022)。 "使用 SLOW5 进行快速纳米孔测序数据分析。“自然生物技术。
纸|github
2021
弗格森，JM, H. Gamaarachchi, T. Nguyen, A. Gollon, S. Tong, C. Aquilina-Reid, R. Bowen-James 和 IW Deveson (2021)。 "InterARTIC：一个交互式网络应用程序，用于对 SARS-CoV-2 和其他病毒进行全基因组纳米孔测序分析。“生物信息学。
Du, Q., GC Smith, PL Luu,JM弗格森, NJ Armstrong, CE Caldon, EM Campbell, SS Nair, E. Zotenko, CM Gould, M. Buckley, K.-M。 Chia、N. Portman、E. Lim、D. Kaczorowski、C.-L。 Chan, K. Barton, IW Deveson, MA Smith, JE Powell, K. Skvortsova, C. Stirzaker, J. Achinger-Kawecka 和 SJ Clark (2021)。 "DNA 甲基化是维持 DNA 复制时间精度和 3D 基因组组织完整性所必需的。" 细胞报告 36(12)。
纸
爱德华兹，RJ，MA 场，JM弗格森, O. Dudchenko, J. Keilwagen, BD Rosen, GS Johnson, ES Rice, D. Hillier, JM Hammond, SG Towarnicki, A. Omer, R. Khan, K. Skvortsova, O. Bogdanovic, RA Zammit, EL Aiden, WC 沃伦和 JWO 巴拉德 (2021)。 "原始巴森吉犬 (Canis lupus familiaris) 基因组的染色体长度基因组组装和结构变异。" BMC 基因组学 22(1): 188。
2020
史密斯，MA，T. Ersavas，JM弗格森, H. Liu, MC Lucas, O. Begik, L. Bojarski, K. Barton 和 EM Novoa (2020)。 "使用纳米孔测序和深度学习对天然 RNA 进行分子条形码。" 基因组研究 30(9): 1345-1353。
公牛，RA，田纳西州阿迪卡里，JM弗格森, JM Hammond, I. Stevanovski, AG Beukers, Z. Naing, M. Yeang, A. Verich, H. Gamaarachchi, KW Kim, F. Luciani, S. Stelzer-Braid, JS Eden, WD Rawlinson, SJ van Hal 和IW 德维森 (2020)。 "用于快速 SARS-CoV-2 基因组分析的纳米孔测序的分析有效性。" 国家公报 11(1): 6272。
Samarakoon, H., S. Punchihewa, A. Senanayake, JM Hammond, I. Stevanovski,JM弗格森, R. Ragel, H. Gamaarachchi 和 IW Deveson (2020)。 "Genopo：用于便携式 Android 设备的纳米孔测序分析工具包。" 通讯生物学 3(1): 538。
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2019
Singh, M., G. Al-Eryani, S. Carswell,JM弗格森, J. Blackburn, K. Barton, D. Roden, F. Luciani, T. Giang Phan, S. Junankar, K. Jackson, CC Goodnow, MA Smith 和 A. Swarbrick (2019)。 "高通量靶向长读长单细胞测序揭示了淋巴细胞的克隆和转录景观。" 国家公报 10(1): 3120。
弗格森，JM和 MA 史密斯 (2019)。 "SquiggleKit：一个用于处理纳米孔信号数据的工具包。" 生物信息学 35(24): 5372-5373。