top of page
4Gf_tFdh_400x400.jpg

詹姆斯·M·弗格森

生物信息学家

我是一名生物信息学家，专门研究基因组技术、实时纳米孔测序、信号分析、机器学习和相关硬件。我有软件开发背景和十多年的病理学行业经验。

研究兴趣

我是 Garvan 研究所的一名基因组系统分析师，拥有临床病理学测试、算法和软件开发方面的背景。在人口基因组学中心的基因组技术组内领导计算开发，我运用我的独特技能开发新的生物信息学工具，以及设计和支持纳米孔测序基础设施。

​

我的研究领域包括：

  • 纳米孔信号分析

  • 临床测试和方法开发

  • 短串联重复障碍

  • 病毒基因组学（HIV/SARS-Cov-2）

  • 单细胞测序

  • 直接RNA测序

  • 基因组组装

  • 甲基化检测

  • 机器/深度学习

Contact

出版要闻

m_btz586f1.jpeg
Screen Shot 2019-10-11 at 13.58.23.png

弗格森，JM和 MA 史密斯 (2019)。 "SquiggleKit：一个用于处理纳米孔信号数据的工具包。" 生物信息学 35(24): 5372-5373。

史密斯，MA，T. Ersavas，JM弗格森, H. Liu, MC Lucas, O. Begik, L. Bojarski, K. Barton 和 EM Novoa (2020)。 "使用纳米孔测序和深度学习对天然 RNA 进行分子条形码。" 基因组研究 30(9): 1345-1353。

弗格森，JM, H. Gamaarachchi, T. Nguyen, A. Gollon, S. Tong, C. Aquilina-Reid, R. Bowen-James 和 IW Deveson (2021)。 "InterARTIC：一个交互式网络应用程序，用于对 SARS-CoV-2 和其他病毒进行全基因组纳米孔测序分析。“生物信息学。

接触
信息

基因组技术集团
人口基因组学中心

加文医学研究所

j.ferguson@garvan.org.au

  • github
  • LinkedIn
  • Twitter
  • mastodon

感谢提交！

©2022 詹姆斯·M·弗格森。创建于维克斯网

bottom of page
Mastodon Verification